El Consejo Directivo es el máximo órgano de dirección de la Institución Universitaria y estará integrado por:
- El Alcalde de Medellín o su delegado, quien lo presidirá.
- El Ministro de Educación Nacional o su delegado.
- Un miembro designado por el Presidente de la República que haya tenido vínculos con el sector universitario.
- Un Representante de las Directivas Académicas, uno de los Docentes, uno de los Egresados, uno de los Estudiantes, uno del Sector Productivo y un Exrector de institución de educación superior.
- El Rector de la Institución con voz y sin voto.
El Consejo Directivo está integrado actualmente por:
- Orlando Uribe Villa, Delegado del señor Alcalde y Presidente del Consejo Directivo
- Juan Camilo Palacio, Representante del señor Presidente de la República
- Vacante, Representante del señor Ministro de Educación Nacional
- Alejandro Olaya Dávila, Representante del Sector Productivo
- José María Maya Mejía, Representante de los Ex Rectores Universitarios
- Marcela Omaña Gómez, Representante Principal de las Directivas Académicas
- Juan Guillermo Paniagua Castrillón, Representante Principal de los Profesores
- Deisy Johana Salazar Yepes, Representante Principal de los Egresados
- Esteban Carmona Ospina, Representante Principal de los Estudiantes
- Alejandro Villa Gómez Rector, con voz y sin voto
- Juan Esteban Álzate Ortiz, Secretario General y Secretario del Consejo Directivo, sin voz y sin voto
